Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA4P51532 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms