Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERFP50548 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERFP50548 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERFP50548 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms