Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRE11P49959 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRE11P49959 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRE11P49959 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms