Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP4P49662 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP4P49662 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP4P49662 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms