Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTPAP49638 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TTPAP49638 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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