Protein–RNA interactions for Protein: P48741

HSPA7, Putative heat shock 70 kDa protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA7P48741 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPA7P48741 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPA7P48741 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms