Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCR1P46094 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.05■□□□□ 0
XCR1P46094 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCR1P46094 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCR1P46094 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCR1P46094 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
XCR1P46094 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCR1P46094 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
XCR1P46094 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
XCR1P46094 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XCR1P46094 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCR1P46094 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCR1P46094 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCR1P46094 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCR1P46094 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCR1P46094 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCR1P46094 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms