Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms