Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP2P42575 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms