Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPOP42166 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms