Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC19A1P41440 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms