Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP12P39900 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms