Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDIT3P35638 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDIT3P35638 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms