Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167 ms