Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms