Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms