Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRDP23468 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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