Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD247P20963 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD247P20963 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms