Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGAVP06756 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms