Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP2O95045 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP2O95045 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms