Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJB3O75712 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJB3O75712 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJB3O75712 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms