Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms