Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPLO60437 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPLO60437 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPLO60437 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPLO60437 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPLO60437 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPLO60437 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPLO60437 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms