Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GOLGA8SH3BPF8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA8SH3BPF8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms