Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E9PBE3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E9PBE3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E9PBE3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms