Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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