Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms