Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms