Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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