Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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TNRC6BQ9UPQ9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TNRC6BQ9UPQ9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TNRC6BQ9UPQ9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TNRC6BQ9UPQ9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TNRC6BQ9UPQ9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TNRC6BQ9UPQ9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TNRC6BQ9UPQ9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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