Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF8Q9UPP1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHF8Q9UPP1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms