Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSEQ9UL01 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms