Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms