Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM8A1Q9UBU6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms