Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms