Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms