Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms