Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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