Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN6Q9NWW5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN6Q9NWW5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN6Q9NWW5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN6Q9NWW5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN6Q9NWW5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN6Q9NWW5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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