Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00597Q9H2U6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms