Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA4CQ9C0C4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms