Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FOXQ1Q9C009 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXQ1Q9C009 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
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