Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNC2LI1-204ENST00000406852 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104078.1-201ENST00000499292 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms