Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF6Q9BYE7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms