Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms