Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms