Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM79Q9BSE2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms