Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREX2Q9BQ50 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREX2Q9BQ50 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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