Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms