Protein–RNA interactions for Protein: Q96KB5

PBK, Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBKQ96KB5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PBKQ96KB5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBKQ96KB5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms